Később edzőként maradt a sportág mellett, előbb a Rekard SE, majd a GYAC színeiben. Utóbbi klubnak napjainkban is az vezetőedzője, és a szakosztály életét is ő irányítja. Tanítványai közül többen nemzetközi szinten is komoly eredményeket értek el. Kaiser János nem kizárólag súlyemelőknek tart képzéseket, egyéni edzésein gyakran megfordulnak más sportágak képviselői is – például küzdősportolók, Spíler – Kaiser János súlyemelő vezetőedző, GYAC