A Szőlő utcai javítóintézet ügyében nemcsak a bántalmazásos videók és a házirenddel ellentétes gyakorlat vet fel kérdéseket, hanem az is, hogyan kezelték a lehetséges bizonyítékokat. A hatóságok több mint fél évet késlekedtek az érintett helyiségek átvizsgálásával, az ügyészség szerint a nyomozás elrendelése után a volt igazgató környezetéhez tartozó személy próbálhatott eltüntetni nyomokat.