Az Állami Számvevőszék elnöke szerint Magyar Péter ismétlődő nyilvános bírálatai már az intézmény alkotmányos függetlenségét érintik. Windisch László ezért levélben kérte Baka András köztársasági elnök fellépését, hogy a végrehajtó hatalom tartsa tiszteletben a független intézmények autonómiáját. Az ÁSZ és a miniszterelnök vitája elsősorban a kampányfinanszírozás és az MNB alapítványainak ügye körül éleződött ki.