A Pécsi Tudományegyetem több eljárásban is vizsgálja a Filozófia Doktori Iskola működésével kapcsolatos felvetéseket. A vita egy oktató nyílt levele nyomán robbant ki, aki szerint a képzésben szakmai és etikai problémák merülhettek fel, az érintettek viszont visszautasítják a vádakat.