Komoly ökológiai kockázatot jelent a Balaton számára a hajózási kultúra hiánya, ugyanis a vitorlázók egy része a tóba üríti a szennyvizet és az emberi fekáliát. Vasas Gábor, a HUN-REN Balatoni Limnológiai Kutatóintézet főigazgatója szerint a felelőtlen emberi magatartás és a klímaváltozás együttesen drasztikus változásokat idézhet elő a tó élővilágában.