A mélyvénás trombózis kezelésének elsődleges célja a vérrög növekedésének és leszakadásának megakadályozása, annak feloldódásának elérése, a későbbiekben pedig a trombus ismételt kialakulásának megelőzése. A terápiára gyógyszerek, műtéti megoldások és gyógyászati segédeszközök is rendelkezésre állnak.