A DeepSeek nem szolgáltatott bizonyítékot arra, hogy az EU előírásainak megfelelő szintű adatvédelme lenne a németországi felhasználók számára, ezért a német adatvédelmi biztos a DeepSeek alkalmazás eltávolítását kérte az iOS és Android alkalmazásáruházból. Az aggályokat erősíti, hogy a cég állítólag együttműködik egyes kínai szolgálatokkal.