A pajzsmirigybetegségek kezelése gyakran a hiányzó hormon pótlásával valósul meg. A hormonkezelés időtartama és a szükséges dózis függ a konkrét betegségtől, a pajzsmirigy állapotától, a beteg fizikai jellemzőitől, ezért rendszeres kontroll szükséges, elkerülendő a túl- vagy alulkezelést.